一、核心前提：明确两大经营模式的界定边界
（一）自产自销模式
典型案例：农户种植蔬菜直接销售、养殖合作社销售自产鸡蛋、“公司 + 农户” 模式回收代养肉鸡销售。
（二）收购加工模式
初加工：仅做清洗、切分、晾晒、冷冻、脱壳、分级包装等简单物理处理，不改变农产品原有属性（如收购小麦磨成面粉、新鲜蔬菜切分冷冻）；
深加工：经发酵、提炼、蒸煮、调制等复杂工艺处理，改变原产品形态与属性（如收购大豆酿成酱油、面粉做成面包、水果冻干）。
二、税收优惠差异核心对比（2025-2027 年政策）
优惠维度 | 自产自销模式 | 收购加工模式（初加工） | 收购加工模式（深加工） |
增值税 | 1. 销售自产初级农产品：全额免征增值税（无销售额限额）；2. “公司 + 农户” 模式销售畜禽：视同自产免税；>3. 叠加小规模优惠：若同时销售其他应税产品，合并计算后月销≤10 万仍可免其他产品增值税。 | 1. 外购初加工（如切分蔬菜）：按小规模通用政策执行 —— 月销≤10 万免税，超 10 万按 1% 征收增值税；2. 流通环节特定产品：批发零售蔬菜、部分鲜活肉蛋的初加工品，可享受增值税免税。 | 1. 无专项免税政策，按小规模通用规则计税：月销≤10 万免税，超 10 万按 1% 缴纳增值税；>2. 进项税抵扣：因小规模纳税人无法抵扣进项税，加工成本中的外购农产品支出不可抵扣税额。 |
个人所得税 / 企业所得税 | 1. 个体工商户 / 个人独资企业：按 “经营所得” 计税，可扣除生产投入成本（如种子、饲料、农药）；>2. 无额外专项优惠，按小规模通用政策 —— 年应纳税所得额≤100 万部分减半征收（实际税负低至 2.5%）。 | 1. 若单独核算初加工收入：从事农产品初加工业务的所得，可全额免征企业所得税（个体工商户适用经营所得减征）；2. 未单独核算：无法享受初加工免税，按通用政策计税。 | 1. 无专项免税政策，按小规模通用规则计税（个体工商户经营所得 5%-35% 超额累进税率，年应纳税所得额≤100 万减半征收）；2. 成本扣除：可扣除外购原料、加工设备、场地租金等支出。 |
附加税费 | 随增值税免征，全额无需缴纳城建税、教育费附加等。 | 增值税免税时同步免征附加税；增值税征税时（超 10 万），附加税减按 50% 缴纳。 | 与初加工一致：增值税免税时免附加税，征税时附加税减按 50% 缴纳。 |
特殊政策 | 农民专业合作社销售本社成员自产农产品，同样免征增值税。 | 收购农产品时，需开具农产品收购发票作为成本扣除凭证（无抵扣税额功能）。 | 无特殊政策，需留存加工流程说明、原料采购凭证备查。 |
三、关键实操要点：避坑指南与优惠享受条件
（一）自产自销模式：免税政策的 “享受门槛”
产品范围限制：仅初级农产品可免税，若将自产茶青加工为精制茶、自产水果做成果汁，需按加工产品计税，不得享受自产免税；
凭证留存要求：需保存土地租赁合同、种苗采购发票、“公司 + 农户” 委托养殖合同等，证明产品为 “自产”，避免被认定为外购销售；
开票规范：只能开具增值税普通发票，税率栏选择 “免税”，不得开具专用发票；一经放弃免税，36 个月内不得恢复。
（二）收购加工模式：初加工与深加工的 “税务分界”
加工类型判定：核心看 “是否改变原有属性”—— 蔬菜切分、粮食脱粒是初加工（可享所得税免税），腌制咸菜、水果冻干是深加工（无专项优惠）；
收入核算要求：同时从事初加工和深加工的，需单独核算两类业务的收入、成本，仅初加工部分可享受所得税免税，未分别核算则无法享受；
风险警示：严禁 “外购冒充自产” 享受免税（如收购他人蔬菜谎称自产销售），属于偷税行为，将面临税款追缴 + 滞纳金 + 1-3 倍罚款。
（三）通用合规要点
销售额计算：所有模式下，应税销售额均含线上线下销售、批发零售等全部收入，跨渠道收入需合并计算，不得拆分规避限额；
申报规范：自产自销免税需在《增值税及附加税费申报表》“免税销售额” 栏次填报，收购加工按小规模通用流程申报，零申报也需按时提交；
政策衔接：小规模纳税人 “月销≤10 万免税” 政策适用于所有模式，收购加工模式若月销未超 10 万，无论初加工还是深加工，均无需缴纳增值税。
四、典型案例：优惠差异的实际影响
案例 1：自产自销模式（养殖合作社）
增值税：鸡蛋销售全额免税，饲料销售合并计算后月销超 10 万，按 1% 缴纳增值税 500 元（5 万 ×1%）；
个人所得税：扣除饲料、疫苗等成本后，年应纳税所得额 80 万，享受减半优惠，实际缴纳个税 10 万元（80 万 ×25%×50%）。
案例 2：收购初加工模式（蔬菜加工个体户）
增值税：无专项免税，按 1% 缴纳 4000 元（40 万 ×1%）；
个人所得税：单独核算初加工收入，所得全额免征个税，仅需缴纳增值税及附加税。
案例 3：收购深加工模式（食品加工工作室）
增值税：按 1% 缴纳 5000 元（50 万 ×1%）；
个人所得税：扣除小麦采购成本、设备折旧后，年应纳税所得额 90 万，减半后缴纳个税 11.25 万元（90 万 ×25%×50%）。
五、总结：模式选择与优惠最大化建议
自产自销模式：增值税全免 + 成本扣除，适合纯农业生产的小规模纳税人，核心是保留完整自产凭证，避免跨界加工；
收购初加工模式：所得税免税 + 增值税通用优惠，适合外购原料做简单加工的主体，关键是单独核算收入、明确加工类型；
收购深加工模式：无专项免税，需重点通过成本精细化管理（如留存采购发票、设备折旧凭证）降低税负，年收入超 100 万建议委托税务师规划。
农产品小规模纳税人的优惠享受，核心在于 “精准匹配模式与政策”—— 自产自销抓牢 “免税凭证”，收购加工分清 “初深加工”，合规核算与凭证留存是避免风险、最大化红利的关键。
